Caracterización Molecular de Aislamientos de Beauveria spp. y Metarhizium spp. y Detección de ARNS Asociados a Mycovirus
Guardado en:
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis doctoral |
| Fecha de Publicación: | 2023 |
| Descripción: | En este estudio se realizó la caracterización molecular de los aislamientos de una colección de hongos entomopatógenos y la detección de ARNs asociados a micovirus en esta colección, donada a la Escuela de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional (EFC-UNA) por el Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE). De la colección original se recuperaron 32 aislamientos de Beauveria spp. y 15 de Metarhizium spp., a los que se realizó cultivos monospóricos. Se realizó la extracción de ADN de cada cultivo y se identificó la especie de cada aislamiento por medio de la amplificación por PCR y secuenciación de genes parciales y regiones intergénicas. Estos análisis moleculares permitieron determinar la presencia de B. bassiana (29) y B. caledonica (3) en la colección. De la especie B. bassiana se identificaron aislamientos de tres diferentes linajes y además se seleccionaron ocho de los 29, para obtener la secuencia del genoma completo. Los análisis genómicos confirmaron las diferencias observadas de acuerdo al linaje de los aislamientos y profundizaron nuestro entendimiento de los genes asociados a la patogenicidad y a la producción de metabolitos secundarios, entre otros. En el caso de Metarhizium, se identificaron tres especies, M. anisopliae (9), M. bruneum (5) y M. robertsii (1). También se utilizaron microsatélites específicos de cada género para analizar la variabilidad genética en ellos. Los análisis revelaron que cada aislamiento de Beauveria spp. representaba un genotipo distinto. Lo mismo en el caso de los aislamientos de M. anisopliae, mientras que los cinco de M. brunneum se agruparon en cuatro genotipos diferentes. Adicionalmente, se realizó la extracción de ARN de doble cadena (dsRNA, por sus siglas en inglés) para identificar la presencia de posibles micovirus en los aislamientos estudiados. La presencia de dsRNA fue identificada en diez y seis aislamientos de Beauveria y Metarhizium, respectivamente. Además, se realizó una secuenciación parcial de estos elementos en los aislamientos BV-ECA12 (B. bassiana) y MTR-ECA16 (M. anisopliae), en los cuales se identificaron los virus Beauveria bassiana victorivirus 1 (BbVV1), Beauveria bassiana partitivirus 3 (BbPV3), Metarhizium anisopliae victorivirus 1 (MaV-1) y una especie de chrysovirus. Finalmente, el genoma completo de un grupo de ocho aislamientos de B. bassiana de distintos países que pertenecían a la colección (5 Costa Rica, 1 Honduras y 2 de Puerto Rico), fue secuenciado y se realizaron análisis de genómica comparativa entre ellos. Estos son los primeros genomas de B. bassiana de la región de Centroamérica y el Caribe depositados en la base de datos internacional GenBank. |
| País: | Kérwá |
| Institución: | Universidad de Costa Rica |
| Repositorio: | Kérwá |
| Lenguaje: | Español |
| OAI Identifier: | oai:kerwa.ucr.ac.cr:10669/90076 |
| Acceso en línea: | https://hdl.handle.net/10669/90076 |
| Palabra clave: | BEAUVERIA METARHIZIUM GENOMICA MYCOVIRUS |