Diversidad microbiana asociada a chenopodiaceae Halotolerantes: Análisis comparativo de comunidades microbianas de suelo, de rizósferas y de microorganismos endofíticos en Suaeda spp y Atriplex spp
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| Formato: | tesis doctoral |
| Fecha de Publicación: | 2020 |
| Descripción: | Los microbios asociados a las plantas pueden ayudar a mediar tal estrés seco y salino. Nosotros analizaron las comunidades microbianas de la rizosfera, el suelo y la hojarasca asociadas con dos plantas de quenópodos adaptados a la solución salina, Suaeda mexicana, del centro de México y Atriplex canescens, de la región del desierto de Chihuahua de los Estados Unidos. Con el fin de caracterizar la comunidad microbiana cultivable, se tomaron muestras de suelo y hojarasca procesado y analizado mediante métodos tradicionales de enchapado de superficie. Las muestras se sembraron en dieciséis medios de cultivo diferentes: R2A modificado; Casaminoácidos; BHAP; PDA; TYA y YCED. Cada medio contenía 4% o 10% de NaCl (p / v) y se ajustó a pH neutro o básico. Células de 43 cepas, seleccionadas como representantes de los aislados cultivados, se lisaron por congelación-ebullición y directamente aplicado a mezclas de PCR. La amplificación de los fragmentos de rADN 16S se llevó a cabo utilizando los pares de cebadores F984GC-R1378 para bacterias e ITS1F-ITS4 para el único hongo aislar. Las secuencias obtenidas de los productos de PCR obtenidos a partir de aislamientos de Atriplex se homólogo a secuencias de los géneros bacterianos Penibacillus, Streptomyces, Promicromonospora, Rhodococcus, Bacillus y Pseudomonas, y el hongo género Aspergillus. Secuencias homólogas al género Artrhobacter, Streptomyces, Nocardia, Cellulosimicrobium, Pseudomonas y Bacillus fueron amplificado a partir de aislados de Suaeda. El ADN total se extrajo de muestras de suelo y hojarasca en diferentes estaciones (invierno y primavera). Uso de un cebador universal bacteriano 16S, codificado con etiqueta Se utilizó FLX Amplicon Pyrosequencing (TEFAP) para evaluar la diversidad microbiana. Cada uno de los aislamientos se utilizó para la inoculación de cultivos axénicos Se evaluó la promoción del crecimiento de plantas de semillero y plantas de semillero de amaranto spp. |
| País: | Repositorio UNA |
| Institución: | Universidad Nacional de Costa Rica |
| Repositorio: | Repositorio UNA |
| Lenguaje: | Español |
| OAI Identifier: | oai:null:11056/22192 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/11056/22192 |
| Palabra clave: | COMPOSICION DEL SUELO CHENOPODIACEAE MICROORGANISMOS ATRIPLEX ARBUSTOS |